В начале июня во исполнение Постановления № 448 Правительства РФ в России была зарегистрирована Национальная база данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2.
В Российскую Национальную базу геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 (VGARus) загружено уже 40.383 геномных последовательностей коронавируса, в том числе более 19 тысяч полногеномных последовательностей и свыше 21 тысячи фрагментов генома S-белка (участок, позволяющий определять наиболее важные мутации).
Для сравнения, в международную базу данных GISAID загружено только 9,5 тысячи полных геномов SARS-CoV-2 из России. Такие данные представил сегодня Роспотребнадзор. Разработчиком этой программы и консолидирующим центром выступает Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, также активно участвуют ГНЦ "Вектор", ГНЦ Прикладной микробиологии и биотехнологии, НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Российский НИПЧИ "Микроб" и другие.
Регулярное пополнение Национальной базы данных помогает проводить обширный мониторинг эпидемиологической ситуации в нашей стране, отслеживать появление новых геновариантов коронавируса, контролировать их распространение и делать прогнозы на будущее, — пояснили в Роспотребнадзоре.
Кроме того, данные, загруженные российской базой в международную базу GISAID используются для изучения геновариантов, циркулирующих в России, учеными всего мира.
Также сотрудниками ЦНИИ Эпидемиологии разработан алгоритм PARuS для анализа геномных последовательностей SARS-CoV-2, который позволяет производить классификацию вируса по фрагменту S-белка, содержащему информацию о ключевых мутациях, которые, согласно рекомендациям ВОЗ, подлежат специальному мониторингу.
